古DNA是指从古代样本中获取的任何遗传物质。在过去的十年，我们见证了古DNA研究的一场革命。古DNA研究的焦点在很长时间内被限制在了线粒体DNA和一些有限的核基因组标记，但如今已经能够获得非常古老的全基因组数据。这一突破主要是缘于高通量测序技术以及获取高度降解、短片段DNA分子的能力，并催生了古基因组学。古基因组学常用的研究对象有线粒体、Y染色体和常染色体。近年来，古基因组学研究促进了认识全新世人类在各大洲的扩散。古基因组学像放射性碳测定年代一样，未来将成为考古学和历史学研究的常规工具。